由于腐植酸的化學組成和結構特別復雜，因此實踐中腐植酸的抽提、分離技術多種多樣，但也存在著各種難題。通常情況下，腐植酸的抽提技術有以下幾種：
(1) 堿法提取。常用的提取劑有氫氧化鈉、氫氧化鉀、氨水等；
(2) 酸法提取。主要的溶劑包括各種有機無機酸，如硝酸、草酸等；
(3) 中性鹽提取法。其中，中性鹽可以是氟化鈉、草酸鈉、焦磷酸鈉等；
(4) 有機溶劑萃取。常用的有機溶劑有二甲亞砜、乙醇、丙酮等。
同一種原料，相同的提取條件，應用不同的提取劑和提取工藝會對腐植酸的提取能力產生較大的影響。
通過堿法提取的腐植酸鹽溶液，包括黑腐酸鹽、棕腐酸鹽和黃腐酸鹽。根據黑、棕腐植酸不溶于酸，而黃腐酸溶于酸的特性，在腐植酸溶液中加入無機酸，使溶液pH值控制在2左右，得到的黃色的溶液，即為粗黃腐植酸。沉淀物中加入乙醇或丙酮，溶解的部分為棕腐酸，不溶物是黑腐酸。